《三叶草研究所》是一部关于青少年探险的动画片，第1集的故事围绕着主人公们进入神秘的三叶草研究所展开。这座废弃已久的研究所隐藏着许多未知的秘密，引起了主人公们的好奇心。
在第1集中，主人公们小明、小杰和小丽听说了关于三叶草研究所的传说，决定一探究竟。他们来到研究所门口时，意外地发现了一个被遗弃的实验室，里面装满了各种奇怪的仪器和设备。他们悄悄潜入实验室，却被一只神秘的生物发现了。
这只生物是一只看起来像兔子又像蜥蜴的怪物，它对主人公们展开了攻击。在千钧一发之际，主人公们紧急躲避并想尽办法逃脱。最终，在他们的合作下，成功解决了这只怪物，取得了逃离研究所的机会。
第1集结束时，主人公们在逃出研究所后，决定继续探索三叶草研究所的秘密。他们的冒险才刚刚开始，观众们也跟随着他们一起展开了一场充满惊险刺激的探险之旅。